在商业交易中，POS机的使用已成为常态，但在某些情况下，由于各种原因，商家可能会遇到POS机发货后未及时激活需要退回代理商的情况。这时，运费由谁承担成了一个需要考虑的问题。让我们深入探讨这个问题，以帮助您更好地理解相关情况。

如果是因为商家的原因导致POS机未及时激活，例如商家未能在规定时间内完成设置或激活流程，那么商家可能需要承担退回的运费。这主要是因为商家自身的原因导致了退货的需要，所以相应的责任和费用应由商家承担。

另一方面，如果是因为POS机存在质量问题导致商家无法及时激活，那么代理商应该承担退回的运费。代理商作为销售方，有责任确保所售商品的质量，并且在商品出现问题时提供相应的售后服务。因此，在这种情况下，代理商应该承担退货运费以弥补商家的损失。

当然，具体情况还需根据双方的协商和合同条款来确定。如果双方在合同中明确规定了运费承担方式，那么应按照合同条款执行。如果合同中未明确规定，双方可以协商解决运费问题。

总之，在处理POS机发货后未及时激活需退回代理商的情况时，双方应保持沟通，明确责任归属，并根据实际情况协商运费承担方式。这样可以确保问题得到妥善解决，同时维护双方的利益。